Listan nedan innehåller olika programvaruprojekt som kan vara av intresse för projektet Debian-Med. För närvarande är bara några av dem tillgängliga som Debianpaket. Vårt mål är dock att ta med all programvara som vi tror kan göra Debian-Med till en högkvalitativ skräddarsydd Debiandistribution.
Varje huvudrad har en färgkod enligt nedan beskrivet schema för att ge en bättre översikt över huruvida projektet är tillgängligt som Debianpaket.
Om du upptäcker ett projekt som du tycker borde kunna passa i Debian-Med, eller om du har skapat ett inofficiellt Debianpaket, tveka inte att sända in en beskrivning av projektet till sändlistan för Debian-Med.
|
python-pyepl
http://pyepl.sourceforge.net/ |
Licens:
LGPL
Officiellt Debianpaket |
|
PyEPL är ett stimuli-leverans- och -svarsregistreringsverktyg som kan användas gör att skapa psykologiexperiment (samt även neurovetenskap, marknadsföringsforskning, med mera). Det innehåller
Denna verktygslåda är tänkt som ett alternativ till den ofta använda kommersiella produkten E' (E-Prime). |
|
|
phpESP
http://www.butterfat.net/wiki/Projects/phpESP/ |
Licens:
BSD
Inofficiellt Debianpaket |
| phpESP är ett paket för PHP som tillhandahåller ett lättanvänt webbaserat gränssnitt för att tillverka enkäter, lägga ut dem på din webbplats och exportera data. Det stöder flera användare och användargrupper, med isolering och dold data mellan grupper. Det är lämpligt att användas av en enskild person, en avdelning eller av en hel organisation. Enkäterna som skapas av phpESP kan enkelt byggas in i existerande HTML-mallar med en eller två nya rader. | |
|
Projektet Den virtuella medicinskolan vid Hammersmithsjukhuset
http://www.soundray.de/vms/ |
Licens:
GPL
Debianpaket ej tillgängligt |
|
Arbetet med att lagra alla bildstudier digitalt tillsammans med radiologens rapport gav en omfattande databas över sjukdomar och hur de ser ut på bild så väl som normal anatomi. Denna databas är, naturligtvis, en extremt värdefull utbildningsresurs. Projektet Den virtuella medicinskolan startades med målsättningen att omvandla denna bilddatabas till en kunskapsbas. Denna kunskapsbas kommer bilda grunden i ett digitalt nätverksbaserat inlärningssystem för alla medicinska områden på grundläggande nivå: den ”Virtuella medicinskolan”. Den baseras mycket på fri programvara (Apache-Cocoon). |
|
|
Internationell klassificering av sjukdomar (ICD-9 och ICD-10)
http://www.cdc.gov/nchs/icd9.htm |
Licens:
Public Domain
Debianpaket ej tillgängligt |
|
Det finns två besläktade klassifikationer av sjukdomar med liknande namn. Den internationella klassificeringen av sjukdomar (ICD) är den indelning som används för att koda och klassificera dödlighetsdata från dödsattester. Den internationella klassificeringen av sjukdomar, klinisk modifiering (ICD-CM) används för att koda och klassificera sjuklighetsdata från sjukhus- och polikliniska journaler, läkarmottagningar och de flesta NCHS-undersökningar. |
|
|
EpiTools
http://www.epitools.net/ |
Licens:
GPL
Debianpaket ej tillgängligt |
|
Fritt tillgängliga numeriska verktyg och metoder för epidemiologi. Den huvudsakliga målgruppen är den epidemiologer och dataanalyserare inom hälsoväsendet. Med R, en programmeringsspråksmiljö i öppen källkod för statistk och grfik, finns det numeriska verktyg och programmeringslösningar som har använts och testats i verkliga epidemiologiska tillämpningar. Många praktiska problem med analys av data från hälsovården kräver programmering eller speciell programvara, och forskare på olika platser kan duplicera programmeringsarbete som gjorts på andra platser. Ofta görs inte enkla analyser, som upprättande av konfidensintervall, och därför görs det svårare att få fram statistiska inferenser inom små geografiska områden. Det finns många exempel på enkel och verkningsfulla numeriska verktyg som kunde förbättra epidemiologers arbete inom lokal hälsovård och som inte är lätt tillgängliga för det problem de sitter med (t.ex exakta konfidensintervall för små mängder incidenter, statistiska poolningsmetoder för metaanalys, livstidsriskberäkningar, osv.). Genom att dessa verktyg blir tillgängliga kommer det att uppmuntra till bredare användning av lämpliga metodere och främja bevisbaserad praktik inom lokal hälsovård. |
|
|
Surveillance
http://www.statistik.lmu.de/~hoehle/software/surveillance/ |
Licens:
GPL
Debianpaket ej tillgängligt |
| Meningen med R-paketet surveillance är att tillhandahålla ett testlabb för övervakningsalgoritmer. Det gör det möjligt för användare att testa nya algoritmer och jämföra deras resultat med vanliga övervakningsmetoder. Bland annat innehåller paketet en implementation av de procedurer som beskrivs av Stroup m.fl. (1989), Farrington m.fl. (1996) och det system som används av Robert Koch-institutet (RKI), Tyskland. För utvärderingsändamål innehåller paketet exempeldata som kommer från SurvStat@RKI-databasen som finns hos RKI, Tyskland. Mer fullständiga jämförelser med simuleringsstudier är möjliga för att simulera punktvisa utbrottsdata med en dold Markov-modell. För att jämföra algoritmerna kan benchmarkvärden, som känslighet, specificitet och detekteringsfördröjning beräknas för hela uppsättningar av övervakningstidsserier. | |
|
OHF STEM
http://www.eclipse.org/ohf/components/stem/ |
Licens:
Free
Debianpaket ej tillgängligt |
| Verktyget Spatiotemporal Epidemiological Modeler (STEM) är tänkt att hjälpa vetenskapsmän och folk inom hälsovården att skapa och använda spatiella och temporala modeller över utbrytande infektionssjukdomar. Dessa modeller kan göra det enklare att förstå, och potentiellt förhindra, spridningen av sådana sjukdomar. STEM är en del av Open Healthcare Framework. | |